Agjencia Kombëtare e Barnave dhe Pajisjeve Mjekësore zbaton të gjitha detyrimet ligjore, të përcaktuara në legjislacionin në fuqi, për vendosjen në treg, eksportin, tregtimin dhe përdorimin e barnave si dhe të pajisjeve mjekësore.

Misioni i kësaj Agjencie është i fokusuar ne drejtimet si:

• Ndërmerr të gjitha veprimet e nevojshme për zbatimin e detyrimeve që lidhen me farmakovigjilencën
• Miraton, sipas rregullave të parashikuara në ligj, formatin e publicitetit për barnat
• Bashkëpunon me institucione analoge jashtë vendit si dhe institucione tw tjera brenda vendit, për çështje të ndryshme të fushës farmaceutike dhe të pajisjeve mjekësore
• Propozon, pranë ministrisë përgjegjëse për shëndetësinë, ndryshime në aktet ligjore dhe nënligjore, me qëllim plotësimin dhe përmirësimin e legjislacionit përkatës
• Kryen procesin e regjistrimit  bazuar në standardet e parashikuara, për pajisjet mjekësore
• Zhvillon procesin e inspektimit për barnat dhe pajisjet mjekësore, në përputhje me aktet ligjore dhe ato nënligjore